Miho (Aya Kato), Reiko (Rie Tezuka) et Chie (Aimi Hoshii), trois lycéennes kendokas assistent par hasard à un combat entre Hazuki / Mighty Wind (Ayumi Onodera) et Eres (Asano Aikawa), leader de l'organisation Irodo. Alors qu'Eres va donner le coup de grâce à une Mighty Wind blessée et affaiblie, les trois écolières viennent préter main forte à cette dernière mais, malgré leur courage et leurs talents de combattante, elles ne sont pas de taille contre Eres. Justy Wind leur remet alors trois bracelets identiques au sien qui leur permettent de se transformer en ninjas et de mettre Eres en fuite. Si Miho (Red Wind) accepte par la suite la proposition d'Hazuki de combattre Irodo à ses côtés, Reiko (Blue Wind) et Chie (White Wind) déclinent l'offre et lui rendent leurs bracelets. Malheureusement pour elles, Eres est du genre rancunière et tend une embuscade aux deux jeunes filles. En tentant de secourir ses amies, Miho se retrouve face au monstrueux Roader.

Enquétant sur une série d'actes de violence commis par des lycéennes jusqu'ici sans histoires, Chie s'inscrit aux mêmes cours particuliers qu'elles. Elle découvre rapidement que PCNer, une créature d'Irodo, est derrière toute cette histoire. PCNer capture Chie et crée un double d'elle pour piéger les autres membres de Justy Wind. Inquiètes du silence de leur amie, Miho et Reiko partent à sa recherche. Tandis que Reiko est attaquée par la fausse Chie, Miho se retrouve face à Eres.